吡咯并吲哚生物碱是药物化学,天然产物化学和有机化学领域都十分关注的一大类天然产物家族,其生理活性极其引人注目,其中C3-位含有芳香类取代基的化学机构类型和生物活性最为广泛。然而,由于其分子结构复杂,化学反应步骤繁多,使得构建和拓展分子骨架十分困难,大大制约了这类化合物的药学和生物学功能的研究和利用。利用酶促反应合成吡咯并吲哚有可能打破此类分子骨架的合成瓶颈,但由于这类结构的特殊性及酶反应的高度专一性,按传统方法从酶库中随机筛选获得这种催化酶无异于大海捞针。
近日,588888纽约国际官方网站邓子新院士团队瞿旭东教授课题组与昆士兰大学和北京理工大学的研究组一起合作成功解析了一种C3-芳香型吡咯并吲哚生物碱naseseazine C的生物合成机制。他们研究发现其实naseseazine C的生物合成异常简洁并且高效,仅需要一个环化酶和一个P450 酶,分别催化合成环二肽底物以及吡咯并吲哚骨架的合成。不过,该P450的催化反应机制前所未闻,包括了自由基引发、异构、分子内的Mannich反应以及分子间的自由基加成消除反应。随后,他们及时应用这种高效的酶催化反应建立了该酶的全细胞催化体系对化学合成的 29 种含有色氨酸的环二肽进行催化,分别得到了 30 个化学结构多样性的C3-芳香型吡咯并吲哚类化合物,实现了此类复杂吡咯并吲哚生物碱骨架多样性的快速、高效制备。生物活性检测发现大部分化合物具有神经保护作用,其中4 个化合物的保护作用比临床药物尼莫地平(nimodipine)更强。这一工作完美地实现了仿生物合成机制于化学合成实践的化学生物学研究思路,对串联自由基酶学机制和芳香型吡咯并吲哚生物碱的高效合成与药学研究提供了宝贵的借鉴,具有重要的科学和应用价值。
10月24日,这一成果的研究论文被国际著名学术刊物《自然•通讯》(《Nature Communications》)正式发表(https://rdcu.be/9XUJ)。瞿旭东课题组的硕士研究生田文雅和博士生孙成海为共同第一作者,瞿旭东教授和昆士兰大学贾新颖博士为共同通讯作者,北京理工大学陈世稆教授和588888纽约国际官方网站朱冬青副教授等参与了研究。该工作得到了国家自然科学基金面上项目的资助。
瞿旭东教授课题组长期从事天然药物分子骨架的生物合成研究,在聚酮、含氮杂环和甾体三大类药物分子骨架的生物合成和结构多样方面取得了一系列系统性、开拓性的研究成果。近年来已在J Am Chem Soc、Angew Chem Int Ed等国际知名刊物上发表研究论文二十余篇,获批国际、国内专利近10项。
图示:芳香型吡咯并吲哚生物碱的高效生物和催化合成